Řeka Jizera je nejvýznamějším pravostranným přítokem Labe. Pramení v Jizerských horách, kde tvoří hranici Českou republikou a Polskem. Řeka propojuje území Krkonoš, Jizerských hor a Českého ráje a je osou celého území.
V kaňonovitých údolích pod zříceninou hradu Trosky se nachází soustava osmi rybníků: Věžák, Nebák, Vidlák, Krčák, Hrudka, Rokytňák, Dolský a Podsemínský. Břehy těchto rybníků lemují většinou pískovcové skály.
Drhlenský rybník leží cca 7 km jihovýchodně od Mnichova Hradiště, východně od Kněžmostu.
Komárovský neboli Velký rybník se nachází v rekreační oblasti Branžež, Nová Ves.
Nedaleko u Jičína, na severovýchod od Prachovských skal u obce Jinolice, se v malebném prostředí nachází skupina tří rybníků – Oborský rybník, rybník Němeček a rybník Vražda.
Rybník Bažantník leží v malebném prostředí Českého ráje v Sedmihorkách, nedaleko Hruboskalského skalního města.
Libuňka pramení v zalesněném svahu mezi Kozlovem a Ředicí, protéká malebnou částí Českého ráje a po 20 km se u Tutnova vlévá do Jizery.
Největší vodní nádrž v prostoru Dolního Bousova je napájena říčkou Klenicí.
Rybník Pardoubek býval společně s nedalekou Bažantnicí oblíbeným výletním místem Lázní Bělohrad.
Rybník Žabakor je se svou rozlohou 45 ha největším rybníkem chráněné krajinné oblasti Český ráj.
Na severozápadním okraji obce, po levé straně silnice Jičín - Lázně Bělohrad se na potoce Studénka nachází rybník Marešák, rybník s písčitou pláží s pozvolným vstupem do vody.
Potok Žehrovka pramení v západní části Prachovských skal a přivádí do řeky Jizery vodu z Českého ráje.
Jeden z nejzachovalejších rybníků o rozloze 50 ha, který leží na Hasinském potoku.
Oba rybníky leží pod hradem Kost a hrály významnou roli v jeho obranném systému.
Obec Ostružno se nachází pod Velišským hřbetem, asi 5 km západně od Jičína. V okolí je několik rybníků - Ostruženský, Čeperka, Lhotský, Vyplatil a Jikavec.
Bývalé přírodní koupaliště ležící v srdci Prachovských skal, obklopeno hustými lesy.